В мире, где гигантские монстры, известные как кайдзю, терроризируют Японию уже на протяжении многих лет, правительство создало Корпус обороны — элитное военное подразделение, предназначенное для защиты граждан от разрушительных атак. Эти храбрые бойцы сражаются с чудовищами, чтобы сохранить мир и безопасность в стране, в то время как профессиональные уборщики, специализирующиеся на устранении последствий, занимаются ликвидацией разрушений. Один из таких уборщиков — Кафка Хибино.
Кафка работает в этом тяжелом и неблагодарном деле, испытывая постоянное недовольство своей жизнью. Его мечта стать членом Корпуса обороны и бороться с кайдзю, как это делает каждый из героев, осталась несбывшейся. Еще в юности он неоднократно пытался попасть в ряды этой элитной команды, но все его попытки окончились неудачей. Теперь, спустя годы, он работает в тени своих кумиаров, занимаясь уборкой после их боев, и только мечты и разочарование остаются его верными спутниками.
Однажды, судьба подбрасывает Кафке неожиданную возможность изменить свою жизнь. После трагического инцидента, Кафка сталкивается с паразитом, который проникает в его тело, наделяя его способностью трансформироваться в самих кайдзю, с которыми он всю жизнь боролся. Этот паразит не только изменяет его физические возможности, но и предоставляет ему уникальный шанс осуществить свою давнюю мечту — стать частью Корпуса обороны, но уже с новой ролью и новыми задачами.